Предысторией музея – в 1964 году во Дворце культуры Волгоградгидростроя был организован народный музей Волжского, первой заведующей которого была Белявская М.Я.
Историко-краеведческий музей и городской выставочный зал официально был создан 14 августа 1968 года в здании бывшего магазина «Детский мир» по улице 50 лет Октября,10. Затем, 4 апреля 1970 года в здании по улице Фонтанной (50 лет Октября), 10 произошло торжественное открытие экспозиций музея. Первой заведующей музея была К.В. Митерева. Музей был создан благодаря пониманию руководства молодого города. Дело в том, что музей по требованиям того времени создавался в населённом пункте с численностью населения 300 тысяч и более, а наш город тогда ещё не достиг таких размеров. Поэтому сначала он являлся филиалом Волгоградского областного краеведческого музея, а в 1994 году - стал самостоятельным учреждением культуры.
В настоящее время у Волжского историко-краеведческого музея есть филиал - Зал Воинской Славы (в ДК «Октябрь»), и отдел Истории Волжского и Донского казачества (пр. Ленина, 54).